常にSEOとホームページ制作を同じ会社に依頼しないといけないという事はありません。
同じ会社に依頼すると、作業効率がよかったり、費用の節約につながるかもしれません。
しかし、SEOとホームページ制作の両方を得意としている場合にはいいですが、片方だけを得意としている会社であれば、それぞれを別の会社に依頼するという事もできるでしょう。
SEO会社とホームページ制作会社のそれぞれの専門家に依頼する事で、適材適所となり、高い効果を期待できそうですね。
また検索エンジン対策については、結果がなかなか出ない場合には、別のSEO会社に変更するという事もできる様です。契約の期間や解約について理解しておいて、専門家に相談してみたいですね。